MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia sp. CCGE1002 chromosome 2

Total Repeats: 58117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014118	ATT	2	6	225	230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295698849
2	NC_014118	GA	3	6	278	283	50 %	0 %	50 %	0 %	295698849
3	NC_014118	GAC	2	6	316	321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698849
4	NC_014118	TA	3	6	382	387	50 %	50 %	0 %	0 %	295698849
5	NC_014118	CATG	2	8	452	459	25 %	25 %	25 %	25 %	295698849
6	NC_014118	TCG	2	6	534	539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698849
7	NC_014118	GGC	2	6	679	684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698850
8	NC_014118	A	8	8	716	723	100 %	0 %	0 %	0 %	295698850
9	NC_014118	TGG	2	6	725	730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295698850
10	NC_014118	TA	3	6	746	751	50 %	50 %	0 %	0 %	295698850
11	NC_014118	GCTT	2	8	962	969	0 %	50 %	25 %	25 %	295698850
12	NC_014118	CGGA	2	8	977	984	25 %	0 %	50 %	25 %	295698850
13	NC_014118	CCCA	2	8	1195	1202	25 %	0 %	0 %	75 %	295698851
14	NC_014118	CGA	2	6	1226	1231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698851
15	NC_014118	CCCGG	2	10	1270	1279	0 %	0 %	40 %	60 %	295698851
16	NC_014118	AAG	2	6	1282	1287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295698851
17	NC_014118	GC	3	6	1298	1303	0 %	0 %	50 %	50 %	295698851
18	NC_014118	CAG	2	6	1395	1400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698851
19	NC_014118	GTT	2	6	1431	1436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295698851
20	NC_014118	TCG	2	6	1438	1443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698851
21	NC_014118	TGC	2	6	1457	1462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698851
22	NC_014118	GTC	2	6	1531	1536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698851
23	NC_014118	GCT	2	6	1611	1616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698851
24	NC_014118	TGC	2	6	1769	1774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698851
25	NC_014118	TGA	2	6	1775	1780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295698851
26	NC_014118	CGT	2	6	1800	1805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698851
27	NC_014118	GCG	3	9	1813	1821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698851
28	NC_014118	GCC	2	6	1836	1841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295698851
29	NC_014118	CG	3	6	1850	1855	0 %	0 %	50 %	50 %	295698851
30	NC_014118	CCG	2	6	2039	2044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295698851
31	NC_014118	TGG	2	6	2065	2070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295698851
32	NC_014118	GCTGCG	2	12	2078	2089	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	295698851
33	NC_014118	TCG	2	6	2098	2103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698851
34	NC_014118	TCG	2	6	2108	2113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698851
35	NC_014118	GCG	2	6	2156	2161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698851
36	NC_014118	AGAT	2	8	2182	2189	50 %	25 %	25 %	0 %	295698851
37	NC_014118	TGCCGA	2	12	2237	2248	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	295698851
38	NC_014118	CG	4	8	2253	2260	0 %	0 %	50 %	50 %	295698851
39	NC_014118	CGC	2	6	2271	2276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295698851
40	NC_014118	GAC	2	6	2284	2289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698851
41	NC_014118	GGC	2	6	2307	2312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698851
42	NC_014118	TTC	2	6	2341	2346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295698851
43	NC_014118	GCC	2	6	2349	2354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295698851
44	NC_014118	AGC	2	6	2365	2370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698851
45	NC_014118	CTGT	2	8	2395	2402	0 %	50 %	25 %	25 %	295698851
46	NC_014118	ACC	2	6	2407	2412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	295698851
47	NC_014118	CTG	2	6	2488	2493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698851
48	NC_014118	TTG	2	6	2632	2637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295698851
49	NC_014118	CCG	2	6	2690	2695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295698851
50	NC_014118	AGT	2	6	2807	2812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295698851
51	NC_014118	GCC	2	6	2835	2840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295698851
52	NC_014118	GCC	2	6	2874	2879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295698851
53	NC_014118	ACCG	2	8	2895	2902	25 %	0 %	25 %	50 %	295698851
54	NC_014118	TCG	2	6	2921	2926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698851
55	NC_014118	GCC	2	6	2940	2945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295698851
56	NC_014118	ACG	2	6	3031	3036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698851
57	NC_014118	CGA	2	6	3068	3073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698851
58	NC_014118	GCG	2	6	3089	3094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698851
59	NC_014118	CAG	2	6	3099	3104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698851
60	NC_014118	CGC	2	6	3189	3194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295698851
61	NC_014118	GCG	2	6	3278	3283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698851
62	NC_014118	ACG	3	9	3313	3321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698851
63	NC_014118	GTC	2	6	3366	3371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698851
64	NC_014118	CGC	2	6	3417	3422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295698851
65	NC_014118	CGG	2	6	3426	3431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698851
66	NC_014118	TGCGCC	2	12	3439	3450	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	295698851
67	NC_014118	CCG	2	6	3481	3486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295698851
68	NC_014118	GC	3	6	3505	3510	0 %	0 %	50 %	50 %	295698851
69	NC_014118	GGC	2	6	3527	3532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698851
70	NC_014118	TCC	2	6	3755	3760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	295698852
71	NC_014118	CTG	2	6	3762	3767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698852
72	NC_014118	GTC	2	6	3812	3817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698852
73	NC_014118	GCG	2	6	3836	3841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698852
74	NC_014118	GCC	2	6	3848	3853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295698852
75	NC_014118	CG	3	6	3885	3890	0 %	0 %	50 %	50 %	295698852
76	NC_014118	CGA	2	6	3910	3915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698852
77	NC_014118	GTT	2	6	3928	3933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295698852
78	NC_014118	GC	3	6	3983	3988	0 %	0 %	50 %	50 %	295698852
79	NC_014118	GC	3	6	3995	4000	0 %	0 %	50 %	50 %	295698852
80	NC_014118	CGC	2	6	4004	4009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295698852
81	NC_014118	GCT	2	6	4033	4038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698852
82	NC_014118	GCC	2	6	4092	4097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295698852
83	NC_014118	GC	3	6	4103	4108	0 %	0 %	50 %	50 %	295698852
84	NC_014118	ACG	2	6	4116	4121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698852
85	NC_014118	GCGAGC	2	12	4182	4193	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	295698852
86	NC_014118	CATCG	2	10	4202	4211	20 %	20 %	20 %	40 %	295698852
87	NC_014118	CGG	2	6	4255	4260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698852
88	NC_014118	CGC	2	6	4268	4273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295698852
89	NC_014118	CGA	2	6	4291	4296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698852
90	NC_014118	CGT	2	6	4359	4364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698852
91	NC_014118	CG	3	6	4465	4470	0 %	0 %	50 %	50 %	295698852
92	NC_014118	CG	3	6	4476	4481	0 %	0 %	50 %	50 %	295698852
93	NC_014118	GTGC	2	8	4496	4503	0 %	25 %	50 %	25 %	295698852
94	NC_014118	CG	3	6	4506	4511	0 %	0 %	50 %	50 %	295698852
95	NC_014118	ACG	2	6	4515	4520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698852
96	NC_014118	CGA	2	6	4531	4536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698852
97	NC_014118	TCG	2	6	4539	4544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698852
98	NC_014118	CGA	2	6	4555	4560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698852
99	NC_014118	CGG	2	6	4636	4641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698852
100	NC_014118	CGAG	2	8	4656	4663	25 %	0 %	50 %	25 %	295698852
101	NC_014118	GC	4	8	4686	4693	0 %	0 %	50 %	50 %	295698852
102	NC_014118	GGC	2	6	4740	4745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698853
103	NC_014118	TCT	2	6	4821	4826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295698853
104	NC_014118	AGC	2	6	4877	4882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698853
105	NC_014118	GCA	2	6	4884	4889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698853
106	NC_014118	CG	4	8	4899	4906	0 %	0 %	50 %	50 %	295698853
107	NC_014118	GGC	2	6	4922	4927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698853
108	NC_014118	GCGCA	2	10	4945	4954	20 %	0 %	40 %	40 %	295698853
109	NC_014118	GC	3	6	5031	5036	0 %	0 %	50 %	50 %	295698853
110	NC_014118	GC	3	6	5058	5063	0 %	0 %	50 %	50 %	295698853
111	NC_014118	GC	4	8	5073	5080	0 %	0 %	50 %	50 %	295698853
112	NC_014118	CG	3	6	5121	5126	0 %	0 %	50 %	50 %	295698853
113	NC_014118	CG	4	8	5136	5143	0 %	0 %	50 %	50 %	295698853
114	NC_014118	CATC	2	8	5190	5197	25 %	25 %	0 %	50 %	295698853
115	NC_014118	GCG	2	6	5243	5248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698853
116	NC_014118	CGC	2	6	5259	5264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295698853
117	NC_014118	CGT	3	9	5274	5282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698853
118	NC_014118	TCG	2	6	5327	5332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698853
119	NC_014118	CGG	2	6	5396	5401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698854
120	NC_014118	GCC	2	6	5419	5424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295698854
121	NC_014118	CGT	2	6	5444	5449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698854
122	NC_014118	CGC	2	6	5502	5507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295698854
123	NC_014118	CAG	2	6	5586	5591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698854
124	NC_014118	GGCAGC	2	12	5600	5611	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	295698854
125	NC_014118	TCG	2	6	5632	5637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698854
126	NC_014118	CG	3	6	5759	5764	0 %	0 %	50 %	50 %	295698854
127	NC_014118	GCG	2	6	5782	5787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698854
128	NC_014118	CGC	2	6	5845	5850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295698854
129	NC_014118	AGT	2	6	5855	5860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295698854
130	NC_014118	ACG	2	6	5866	5871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698854
131	NC_014118	AAG	2	6	5872	5877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295698854
132	NC_014118	GC	3	6	5910	5915	0 %	0 %	50 %	50 %	295698854
133	NC_014118	ACC	2	6	5917	5922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	295698854
134	NC_014118	CTT	2	6	5930	5935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295698854
135	NC_014118	GCT	2	6	5939	5944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698854
136	NC_014118	CG	3	6	5945	5950	0 %	0 %	50 %	50 %	295698854
137	NC_014118	CG	3	6	5975	5980	0 %	0 %	50 %	50 %	295698854
138	NC_014118	GTA	2	6	5988	5993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295698854
139	NC_014118	GAT	2	6	6045	6050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295698854
140	NC_014118	GCA	2	6	6080	6085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698854
141	NC_014118	TCA	2	6	6092	6097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295698854
142	NC_014118	GCCGT	2	10	6108	6117	0 %	20 %	40 %	40 %	295698854
143	NC_014118	GCG	3	9	6124	6132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698854
144	NC_014118	TGC	2	6	6161	6166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698854
145	NC_014118	GCT	2	6	6182	6187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698854
146	NC_014118	CGG	2	6	6227	6232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698854
147	NC_014118	CTT	2	6	6311	6316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295698854
148	NC_014118	CGT	2	6	6332	6337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698854
149	NC_014118	CGC	2	6	6353	6358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295698854
150	NC_014118	GC	5	10	6386	6395	0 %	0 %	50 %	50 %	295698854
151	NC_014118	GCA	2	6	6401	6406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698854
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154	NC_014118	GCG	3	9	6521	6529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698854
155	NC_014118	CGG	2	6	6536	6541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698854
156	NC_014118	GC	3	6	6560	6565	0 %	0 %	50 %	50 %	295698854
157	NC_014118	CCAG	2	8	6609	6616	25 %	0 %	25 %	50 %	295698855
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163	NC_014118	CTG	2	6	6963	6968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698856
164	NC_014118	TCGCG	2	10	6970	6979	0 %	20 %	40 %	40 %	295698856
165	NC_014118	GCG	2	6	7121	7126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698856
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172	NC_014118	CG	3	6	7359	7364	0 %	0 %	50 %	50 %	295698856
173	NC_014118	ACAGC	2	10	7379	7388	40 %	0 %	20 %	40 %	295698856
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180	NC_014118	GTGTC	2	10	7607	7616	0 %	40 %	40 %	20 %	295698856
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256	NC_014118	CCA	2	6	9892	9897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	295698859
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259	NC_014118	GGC	2	6	9932	9937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698859
260	NC_014118	CGG	2	6	9956	9961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698859
261	NC_014118	CG	3	6	9987	9992	0 %	0 %	50 %	50 %	295698859
262	NC_014118	CAG	2	6	10010	10015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698859
263	NC_014118	CAG	2	6	10109	10114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698859
264	NC_014118	GAT	2	6	10118	10123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295698859
265	NC_014118	CAG	2	6	10154	10159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698859
266	NC_014118	GCC	2	6	10175	10180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295698859
267	NC_014118	GTC	2	6	10236	10241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295698859
268	NC_014118	T	6	6	10280	10285	0 %	100 %	0 %	0 %	295698859
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372	NC_014118	TACG	2	8	13367	13374	25 %	25 %	25 %	25 %	295698862
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378	NC_014118	GC	3	6	13556	13561	0 %	0 %	50 %	50 %	295698862
379	NC_014118	GGC	2	6	13571	13576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698862
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384	NC_014118	GTG	2	6	13749	13754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295698862
385	NC_014118	CGA	2	6	13765	13770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295698862
386	NC_014118	GTT	2	6	13814	13819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295698862
387	NC_014118	GCC	2	6	13838	13843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295698862
388	NC_014118	CG	3	6	13875	13880	0 %	0 %	50 %	50 %	295698863
389	NC_014118	TCGT	2	8	13900	13907	0 %	50 %	25 %	25 %	295698863
390	NC_014118	CAGCG	2	10	13939	13948	20 %	0 %	40 %	40 %	295698863
391	NC_014118	CG	3	6	13952	13957	0 %	0 %	50 %	50 %	295698863
392	NC_014118	GCG	3	9	13955	13963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295698863
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